Con tu cPanel (panel de control) podrás proteger directorios con contraseña.
Para ponerle contraseña a una carpeta:
1-. Inicia sesión en tu panel de control (www.midominio.com/cpanel)
2-. Debajo de la pestaña "Seguridad" da clic en "Directorios Protegidos con Contraseña"
3-. Te mostrará una lista de todas tus carpetas y archivos en tu website.
4-. Selecciona la carpeta que desees ponerle contraseña.
5-. Elige el texto que desees que se muestre cuando entran a tu directorio sin contraseña.
6-. Da clic en "Guardar"
7-. Elige a los usuarios que tendrán acceso a dicha carpeta en "Agregar/Modificar autorización de usuario".
8-. Podrás ver la lista de usuarios activos